Brouzdal jsem tu a nenašel jsem podobný problém.
Ve zkratce.
Mám iPhone 4 a dřív jsem normálně synchronizoval přes iTunes, všechno šlapalo jak mělo.
Bohužel PC odešel, tak jsem dostal na využití náhradní. Bohužel v době, kdy vycházel mnou očekávaný iOS 5. Pár dnů jsem si říkal, že starý PC se podaří zachránit a já si posléze iOS pěkně zaktualizuju.
Nicméně nevydržel jsem, na náhradní PC nainstaloval iTunes 10 a chtěl si tam nový iOS hodit.
Když telefon připojím, nabídne mě to info o novém iOS, avšak varování před ztrátou aplikací. Pokud kliknu na synchronizovat aplikace, udělá to krok 1 a vycvakne. Žádná chyba, žádné hlášení.
Je mě jasný, že to bude rukama, ale rád si nechám poradit a otevřít oči.
Mockrát díky.